Os agentes infecciosos podem ser transmitidos de forma direta ou indireta.
Transmissão direta de pessoa a pessoa:
É a transmissão causada por agentes infecciosos que saem do corpo de um hospedeiro parasitado (homem ou animal) e passam rapidamente para outro hospedeiro são, ou para si mesmo - caso em que recebe o nome de auto-infeccção.
Nesse modo de transmissão os agentes infecciosos são eliminados dos seus hospedeiros já prontos, desenvolvidos ou com capacidade de infectar outros hospedeiros. As vias de transmissão direta de pessoa podem ser, dentre outras, fecal-oral, gotículas, respiratória e sexual.
Na transmissão fecal-oral, o agente infeccioso é transmitido através da ingestão de alimento ou água contaminados com fezes de uma pessoa doente.